У компартменті запроваджено процедури внутрішнього контролю дотримання правил біобезпеки відповідно до вищезазначених критеріїв та гарантується раннє виявлення контамінації субпопуляції збудником хвороби, щодо якої застосовується компартментизація, забезпечується збір і аналіз даних про захворювання у спосіб та обсягах, що дозволять компетентному органу пересвідчитися, що субпопуляція господарства відповідає його статусу.