Надбавка за виконання функцій державного експерта з питань таємниць виплачується з дня, з якого військовослужбовці стали до виконання обов’язків за посадою, за якою передбачена її виплата (у тому числі у разі тимчасового виконання обов’язків за посадою, до якої вони допущені наказом командира військової частини), але не раніше дня видання наказу по особовому складу про призначення, до дня звільнення від виконання обов’язків за посадою включно або вступу до тимчасового виконання обов’язків за посадою, за якою виплата надбавки не передбачена.
Виплата надбавки здійснюється на підставі наказу начальника ГУР МО України.