Мінпраці протягом двох робочих днів після надходження зведених реєстрів проставляє номер і дату на кожному примірнику (реєструє) або повідомляє про відмову у реєстрації. У повідомленні про відмову у реєстрації зазначається обгрунтування такої відмови.
Підставою для відмови у реєстрації може бути несвоєчасне подання зведеного реєстру та звітів, подання звітів не в повному обсязі, недотримання процедури закупівлі, а також невідповідність спрямування бюджетних коштів, зазначених у реєстрі та звітності, меті та напрямам діяльності за проектом, визначеним Угодою про позику ( 996_053 ) та затвердженим планом заходів з реалізації проекту.
Перший примірник зведених реєстрів повертається до відповідного регіонального підрозділу для використання в роботі під час здійснення видатків, проведення розподілу асигнувань районним підрозділам, а також перерахування субвенції міським і районним у містах підрозділам. Другий примірник зберігається в Мінпраці.