За рахунок коштів державного бюджету на виконання Програми компенсуються витрати суб'єктів, що вживають рибогосподарських заходів незалежно від форми власності.
До рибогосподарських заходів належать:
зариблення внутрішніх водойм та Азово-Чорноморського басейну, штучне відтворення рибних запасів внутрішніх водойм та Азово-Чорноморського басейну, у тому числі створення штучних нерестовищ;
акліматизація і розведення нових видів риб;
протиепізоотичні заходи;
рибницько-меліоративні роботи, проведення гідротехнічних робіт;
рибозахисні роботи.