Оператором СКС може бути посадова особа митниці, яка пройшла:
1) відповідний медичний огляд, за результатами якого стосовно цієї особи встановлено придатність та можливість роботи з джерелами іонізуючого випромінення;
2) кваліфікаційний відбір операторів СКС;
3) навчання від постачальника (виробника, представника, установи чи організації) СКС за напрямом експлуатації такої скануючої системи та всіх її компонентів й отримала відповідний документ (посвідчення) - для ВСКС або навчання (інструктаж) за напрямом експлуатації такої скануючої системи та всіх її компонентів, що проводиться посадовими особами спеціалізованого підрозділу - для БПСКС;
4) спеціальну підготовку операторів СКС та отримала документ, що підтверджує відповідність оператора СКС професійним та особистісним якостям, необхідних для аналізу рентгенівських зображень, отриманих за допомогою СКС;
5) навчання з радіаційної безпеки й отримала відповідний документ (посвідчення).