Створення та функціонування Реєстру, зокрема його програмно-технічних засобів, здійснюються за рахунок коштів державного бюджету, міжнародної технічної допомоги та інших джерел, не заборонених законом.
Власником Реєстру, зокрема його програмно-технічних засобів, та виключних майнових прав на його програмне забезпечення є держава в особі ДПС.