Держателем, адміністратором та технічним адміністратором Реєстру є Мінагрополітики. Власником та володільцем Реєстру, у тому числі його програмно-технічних засобів та виключних майнових прав на його програмне забезпечення, є держава в особі Мінагрополітики.
Функції технічного адміністратора Реєстру на підставі договору з адміністратором Реєстру може здійснювати державне підприємство або державна установа, що належать до сфери управління Мінагрополітики.