Власником Реєстру, зокрема його програмно-технічних засобів та виключних майнових прав на програмне забезпечення, є держава в особі Секретаріату Кабінету Міністрів України.
Секретаріат Кабінету Міністрів України забезпечує створення, впровадження, функціонування, адміністрування, а також модернізацію та розвиток Реєстру.