Ведення Реєстру державних сертифікатів здійснюється з метою:
1) збору, реєстрації, обліку і використання інформації про державні сертифікати і тимчасові допуски, у тому числі забезпечення вільного і безкоштовного доступу до зазначеної інформації шляхом надання витягів з Реєстру державних сертифікатів фізичним і юридичним особам;
2) забезпечення здійснення державного контролю за дотриманням вимог законодавства про благополуччя тварин, зокрема перевірки наявності державних сертифікатів і тимчасових допусків та їх чинності.