Ведення єдиної геоінформаційної системи здійснюється з використанням, зокрема державних і галузевих класифікаторів, довідників та баз даних, які ведуться іншими центральними органами виконавчої влади, довідників, класифікаторів, державних реєстрів та бази даних геологічних звітів, функціонування яких забезпечує адміністратор єдиної геоінформаційної системи.