Власником Державного реєстру, у тому числі майнових прав на його програмне забезпечення, є держава в особі МОЗ.
Держателем та адміністратором Державного реєстру є МОЗ.
Володільцем інформації, що міститься в Державному реєстрі, є держатель Державного реєстру.
Технічним адміністратором Державного реєстру є державне підприємство «Електронне здоров’я», що здійснює адміністрування Державного реєстру відповідно до статті 17 Закону України «Про публічні електронні реєстри».