У разі виникнення розбіжностей між інформацією з різних джерел пріоритет має інформація, надана центральними органами виконавчої влади, облдержадміністраціями, органами місцевого самоврядування, підприємствами, установами, організаціями, що належать до сфери управління Держрибагентства, та підтверджена документально.
У разі зміни інформації про водні об’єкти, що внесена до Реєстру, такі зміни вносяться до Реєстру з повідомленням про це заявника. Інформація про внесення змін подається за запитом Держрибагентства.