Внутрішній контроль здійснюється учасниками бюджетного процесу відповідно до законодавства.
Заходами внутрішнього контролю є сукупність запроваджених управлінських дій у апараті, територіальних органах, районних управліннях, які здійснюються на всіх рівнях бюджетного процесу для впливу на ризики з метою удосконалення функціонального забезпечення бюджетних та фінансових процесів, спрямованих на підтримання фінансової стабільності пенсійної системи; складання та забезпечення виконання бюджету Пенсійного фонду; здійснення ефективного розподілу фінансових ресурсів для пенсійного забезпечення; забезпечення своєчасного і в повному обсязі фінансування та виплати пенсій, допомоги на поховання та інших виплат, які згідно із законодавством здійснюються за рахунок коштів Пенсійного фонду та інших джерел, визначених законодавством.