Головою комісії є керівник суб’єкта.
Головою комісії не може бути керівник суб’єкта, щодо якого надійшло повідомлення.
Голова комісії:
організовує роботу комісії;
визначає функціональні обов’язки кожного члена комісії;
забезпечує дотримання строків та процедур;
визначає порядок денний і перелік питань, що підлягають розгляду;
забезпечує моніторинг ефективності заходів реагування.
У разі відсутності голови комісії його обов’язки виконує заступник.
У разі відсутності голови комісії та його заступника обов’язки голови комісії виконує один із членів комісії, який обирається комісією під час засідання за поданням її секретаря.
У разі встановлення під час діяльності комісії факту вчинення головою комісії насильства та/або жорстокого поводження з дитиною, голова комісії підлягає негайному виключенню із складу комісії. Виконання обов’язків голови комісії у такому випадку виконує його заступник.