Для проведення оцінки комісія застосовує такі методи:
1) базове анкетування.
Комісія готує і надсилає БЕБ, а також іншим визначеним комісією заінтересованим сторонам базову оцінювальну анкету для отримання інформації про об’єкти проведення оцінки, зазначені у пункті 12 цього Порядку (зокрема про діяльність, результати діяльності БЕБ, наслідки і вплив його роботи на економічну безпеку держави, оцінку потенціалу БЕБ, а також про організаційну спроможність виконання визначених Законом завдань);
2) проведення інтерв’ю.
Комісія за згодою осіб проводить інтерв’ю з визначеними нею заінтересованими сторонами, до яких, зокрема, можуть належати:
керівництво та інші працівники БЕБ;
керівництво та інші працівники органів державної влади, з якими відповідно до Закону взаємодіє БЕБ;
члени комітетів Верховної Ради України, до предметів відання яких віднесені питання системи оподаткування і питання організації та діяльності правоохоронних органів, оперативно-розшукової діяльності;
члени Ради громадського контролю при Бюро економічної безпеки та представники громадських організацій;
експерти з питань економічної безпеки держави, науковці;
представники міжнародних та/або іноземних організацій, проектів міжнародної технічної допомоги, дипломатичних місій;
інші заінтересовані сторони;
3) обговорення у форматі фокус-груп, яке проводиться комісією з працівниками БЕБ та/або іншими заінтересованими сторонами, визначеними комісією;
4) проведення аналізу інформації.
Комісія проводить аналіз та узагальнення інформації, отриманої за результатами базового анкетування, інтерв’ю та обговорення у форматі фокус-груп, а також іншої інформації про об’єкти проведення оцінки, зазначені у пункті 12 цього Порядку (зокрема вивчає звіти та інші матеріали про стан забезпечення економічної безпеки в Україні, діяльність БЕБ);
5) проведення аналізу матеріалів інформаційно-пошукової та аналітично-інформаційної роботи, звітів про діяльність, матеріалів щодо здійснення комплексу заходів з оцінювання ризиків у сфері економіки та інших заходів, які вживаються БЕБ на виконання визначених Законом завдань;
6) проведення аналізу матеріалів Єдиного державного реєстру судових рішень за період проведення оцінки.
Комісія проводить аналіз окремих матеріалів, визначених законодавством заходів, віднесених до повноважень БЕБ, здійснених ним у період, щодо якого проводиться оцінка, та матеріалів, підготовлених за результатами здійснення таких заходів.
З метою забезпечення проведення всебічної оцінки БЕБ формує первинний перелік справ (матеріалів чи інших документів) за кожним об’єктом проведення оцінки, визначеним підпунктами 2-7 пункту 12 цього Порядку, що здійснювалися та були завершені у період, за який проводиться оцінка. БЕБ надає зазначений перелік комісії протягом 15 робочих днів з дня надходження відповідного запиту від комісії.
Комісія відбирає для аналізу не менше однієї справи за кожним об’єктом проведення оцінки, визначеним підпунктами 2-7 пункту 12 цього Порядку, на підставі первинного переліку справ, наданого БЕБ. БЕБ подає комісії справи, відібрані нею для проведення аналізу, протягом п’яти робочих днів з дня надходження від комісії відповідного запиту.