Заінтересований орган під час організації та проведення конкурсу має такі повноваження:
бере участь у формуванні пріоритетної тематики та вихідного технічного завдання за такою тематикою;
подає пропозиції щодо кандидатур для включення до складу Міжвідомчої робочої групи з формування пріоритетної тематики, за якою здійснюватиметься державне замовлення на найважливіші науково-технічні (експериментальні) розробки та науково-технічну продукцію (далі - Міжвідомча робоча група);
подає пропозиції щодо кандидатур його представників на рівні не нижче керівника структурного підрозділу для включення їх до складу Науково-технічної ради Міністерства освіти і науки з питань формування та виконання державного замовлення на найважливіші науково-технічні (експериментальні) розробки та науково-технічну продукцію (далі - Науково-технічна рада);
подає пропозиції щодо кандидатур кураторів;
погоджує технічне завдання на виконання науково-технічної роботи за відповідною пріоритетною тематикою під час укладання договору на виконання науково-технічної роботи за державним замовленням на науково-технічні (експериментальні) розробки та науково-технічну продукцію (далі - договір) з юридичною особою будь-якої організаційно-правової форми чи форми власності, визначеною переможцем конкурсу;
бере участь у заслуховуванні та прийманні проміжних, остаточних результатів виконання науково-технічної роботи відповідно до умов договору.