Програмне забезпечення має забезпечувати повний цикл оброблення електронного звіту:
створення електронного звіту відповідно до уніфікованого формату, накладення кваліфікованого електронного підпису на електронний звіт, передавання та контроль проходження електронних звітів і квитанцій у системі електронної звітності;
здійснення автоматичного контролю за узгодженістю показників одного та різних електронних звітів, які створюються респондентом;
автоматичне створення транспортного повідомлення;
застосування засобу кваліфікованого електронного підпису чи печатки, сумісних з аналогічними засобами, що використовуються ЦОЕЗ;
шифрування електронного звіту засобами, що мають позитивний експертний висновок за результатами державної експертизи у сфері криптографічного захисту інформації та сумісні із засобами ЦОЕЗ;
перевірку кваліфікованого електронного підпису, накладеного на електронний звіт, та квитанції з використанням кваліфікованого сертифіката відкритого ключа за допомогою засобу кваліфікованого електронного підпису чи печатки;
зберігання (архівування) переданих електронних звітів і квитанцій та можливість їх поновлення;
експорт електронних звітів і квитанцій на зовнішні носії інформації (диски, флеш-накопичувачі тощо), а також їх візуальне відображення та друк;
вивантаження даних електронного звіту до файлів, структуру яких узгоджено з адресатом звітності, для подальшого оброблення;
надання доступу адресатам лише до звітів підвідомчих їм суб’єктів господарювання;
зведення/консолідацію фінансових звітів респондентів для подання уповноваженими органами управління до Мінекономрозвитку та Мінфіну;
можливість прикріплення пояснювальних записок до окремих звітів та зведених звітів;
узагальнення Мінекономрозвитку зведених звітів та пояснювальних записок до них, сформованих уповноваженими органами управління, для подання заінтересованим користувачам;
можливість формування інформаційних довідок відповідно до запитів суб’єктів системи електронної звітності в межах компетенції за інформацією, що зберігається в базі даних ЕЗ, із використанням фільтрів.