Принципами організації роботи з повідомленнями про корупцію в Укртрансбезпеці є:
відповідальність — забезпечення уповноваженим підрозділом організації роботи з повідомленнями про корупцію;
доброчесність — спрямованість дій працівників Укртрансбезпеки на захист публічних інтересів та їх відмова від превалювання приватних інтересів під час виконання ними посадових обов’язків;
доступність — забезпечення безперешкодного зручного доступу для подання повідомлення про корупцію;
достатність повноважень — користування працівниками уповноваженого підрозділу, які здійснюють попередній розгляд повідомлень про корупцію, всіма правами та реалізація повноважень, необхідних для перевірки наведеної в таких повідомленнях інформації, а також для співпраці з викривачами та захисту їх прав, що передбачені Законом і Типовим положенням про уповноважений підрозділ (уповноважену особу) з питань запобігання та виявлення корупції, затвердженим наказом Національного агентства з питань запобігання корупції від 27 травня 2021 року № 277/21, зареєстрованим у Міністерстві юстиції України 14 липня 2021 року за № 914/36536;
ефективність — своєчасне та належне реагування на всі без винятку випадки порушення вимог Закону;
захист прав викривачів — забезпечення дотримання прав та гарантій захисту викривачів;
знання та обізнаність — інформування працівників Укртрансбезпеки про можливість подати повідомлення про корупцію, їхні права та гарантії захисту, які виникають у зв’язку зі здійсненням такого повідомлення про корупцію, а також повноваження уповноваженого підрозділу щодо його розгляду.