МОН здійснює обробку персональних даних таких категорій суб’єктів:
1) працівників МОН;
2) кандидатів на зайняття вакантних посад, призначення на які здійснюється МОН;
3) кандидатів на призначення державних стипендій Президента України, Кабінету Міністрів України;
4) працівників сфер освіти і науки, які представлені в установленому порядку до відзначення державними нагородами України та відомчими заохочувальними відзнаками МОН;
5) осіб, які звертаються до МОН в порядку, визначеному законами України «Про звернення громадян», «Про доступ до публічної інформації» та «Про безоплатну правову допомогу»;
6) користувачів інформації в інформаційно-комунікаційних системах, держателем яких є МОН;
7) учасників проєктів та заходів, залучення яких здійснюється за рахунок бюджетних коштів відповідних рівнів бюджету, передбаченого законодавством;
8) керівників інститутів громадянського суспільства, керівників проєктів, осіб, залучених до реалізації програм (проєктів, заходів);
9) працівників підприємств, установ та організацій, що належать до сфери управління МОН;
10) кандидатів на заміщення членів Наукового комітету Національної ради України з питань розвитку науки і технологій та Наукової ради Національного фонду досліджень України;
11) кандидатів на посади голови та виконавчого директора Національного фонду досліджень України;
12) керівників наукових установ та закладів вищої освіти, їх заступники та особи, уповноважені на заповнення звітних форм;
13) заявників на участь у конкурсному відборі наукових, науково-технічних робіт та проєктів, які фінансуються за рахунок зовнішнього інструменту допомоги Європейського Союзу (представники закладів вищої освіти, наукових установ та підприємств), експертів (представники закладів вищої освіти та наукових установ);
14) кандидатів на здобуття державних стипендій видатним діячам науки та державних іменних стипендій найкращим молодим вченим для увічнення подій Революції Гідності та вшанування подвигу Героїв України - Героїв Небесної Сотні;
15) заявників (фізичні особи) на отримання свідоцтва на право проведення наукової та науково-технічної експертизи;
16) заявників (представники закладів вищої освіти, наукових установ та підприємств, що належать до сфери управління МОН), кандидатів на отримання стипендії Кабінету Міністрів України, іменних стипендій Верховної Ради України та премії Верховної Ради України;
17) керівників учасника конкурсного відбору науково-технічних (експериментальних) розробок за державним замовленням, наукових керівників науково-технiчної (експериментальної) розробки та її авторів, які підписують конкурсну заявку;
18) керівників наукових установ та закладів вищої освіти, їх заступників, головних бухгалтерів, керівників планових підрозділів виконавців договорів, які уповноважені на підписання договорів, додаткових угод до договорів та звітних документів за відповідний етап виконання робіт за договором;
19) керівників (їх заступників) органів виконавчої влади, Національної академії наук України, національних галузевих академій наук, підприємств, установ, організацій, уповноважених на підписання документів на участь у конкурсному відборі робіт на здобуття премії Кабінету Міністрів України за розроблення і впровадження інноваційних технологій, представників авторських колективів;
20) фізичних осіб - здобувачів наукових ступенів та вчених звань, їх опонентів (офіційних опонентів), членів спеціалізованих вчених рад, наукових консультантів (наукових керівників);
21) працівників підприємств, установ, організацій, що належать до сфери управління МОН;
22) фізичних осіб (одержувачі виплат через апарат МОН);
23) фізичних осіб - підприємці;
24) кандидатів до складу Громадської ради при МОН та членів Громадської ради;
25) кандидатів на здобуття стипендії Кабінету Міністрів України за видатні заслуги у сфері вищої освіти;
26) заявників на участь у конкурсі щодо обрання членів Національного агентства із забезпечення якості вищої освіти;
27) заявників на участь у конкурсному відборі щодо обрання членів Науково-методичної ради та науково-методичних комісій Міністерства освіти і науки України;
28) фізичних осіб (здобувачів освіти).