Під час дії воєнного стану загони морської охорони (разом із кораблями, які входять до його складу) у встановленому законодавством порядку можуть залучатися відповідними органами військового управління Збройних Сил України до ліквідації (нейтралізації) збройного конфлікту на державному кордоні України, міжнародного збройного конфлікту, відсічі збройній агресії проти України.