Умови користування ділянкою надр, визначені у дозволі та у відповідній угоді, можуть бути змінені Мінприроди за погодженням з органами, до компетенції яких належить погодження таких умов, у разі:
зміни в установленому порядку проектної документації на геологічне вивчення, розробку та облаштування родовища;
зменшення площі ділянки надр за ініціативою як надрокористувача, так і відповідних контролюючих органів;
виявлення невідомих на час надання дозволу даних про нові види корисних копалин і супутні компоненти, а також про нові властивості або якість корисних копалин після проведення державної експертизи відповідних геологічних матеріалів.
Заява надрокористувача про зміни умов дозволу та угоди про умови користування ділянкою надр розглядається Мінприроди протягом 90 днів після її надходження.
За результатами розгляду заяви Мінприроди вносить зміни до дозволу та угоди або надсилає надрокористувачу вмотивовану відмову.
Зміни до угоди про умови користування ділянкою надр оформлюються як доповнення до неї і є її невід'ємною частиною.
У разі переоформлення або продовження строку дії дозволу справляється збір у розмірі, визначеному згідно з додатком 2.