У разі виявлення порушень митних правил у процесі сканування оператор системи:
доповідає старшому зміни митного органу про виявлені порушення митних правил;
до товаросупровідних документів долучає відповідний фрагмент роздрукованого рентгенівського зображення та його електронну копію, при необхідності надає коментарі до них і передає зазначені документи старшому зміни митного органу через регулювальника системи.