Оператор системи координує дії регулювальника системи за допомогою рації та відеокамер, які розташовані на робочих модулях системи, контролює дотримання вимог з охорони праці, стежить за відсутністю помилок (збою) у роботі системи, за станом її основних елементів, безпосередньо керує такими процедурами:
розміщення транспортного засобу в санітарній зоні системи;
управління процесом рентгенівського сканування;
передання, збереження, створення в електронному вигляді архіву зображень даних;
вибуття транспортного засобу із санітарної зони системи.