Планові та позапланові перевірки НКРЕ проводить відповідно до Програми проведення планової перевірки ліцензованої діяльності, затвердженої Головою НКРЕ (виконувачем обов'язків Голови НКРЕ), та Програми проведення позапланової перевірки ліцензованої діяльності, затвердженої Головою НКРЕ (виконувачем обов'язків Голови НКРЕ) або начальником відповідного ТП НКРЕ (виконувачем обов'язків начальника ТП НКРЕ).