Комісія утворюється у складі трьох осіб наказом Національного агентства України з реконструкції та розвитку.
До складу Комісії входять повноважні представники Національного агентства України з реконструкції та розвитку, Міністерства економіки України, Міністерства фінансів України на рівні заступників керівників.
Голова Комісії обирається на першому засіданні Комісії її членами.