Створення КІС повинно забезпечити підвищення якості прийняття рішень у сфері забезпечення діяльності НКЦПФР та розвитку ринків капіталу та професійних учасників організованих товарних ринків в Україні на основі комплексної обробки оперативних, аналітичних, нормативно-довідкових, експертних та статистичних даних, що зберігаються в КІС, отриманих з різних джерел, сумісності інформації за рахунок використання єдиних принципів побудови баз даних, єдиних класифікаторів та стандартів.