КІС є інтегрованою системою до складу якої входять наступні складові (підсистеми):
підсистема комплексного ведення реєстрів інфраструктури;
підсистема надання адміністративних послуг в електронному вигляді;
електронний кабінет користувача;
підсистема нагляду;
підсистема правозастосування;
офіційний вебсайт НКЦПФР;
Центр збору фінансової звітності (ЦЗФЗ);
підсистема забезпечення внутрішнього електронного документообігу;
підсистема зовнішньої електронної взаємодії;
підсистема автоматизації внутрішніх ділових процесів.