Зональна лабораторія у своїй діяльності керується Конституцією України ( 254к/96-ВР ), іншими законами України, актами Президента України, Кабінету Міністрів України, Міністерства аграрної політики України, Державного комітету України з питань технічного регулювання та споживчої політики, Державного департаменту ветеринарної медицини, Центральної державної лабораторії ветеринарної медицини та цим Положенням.