До засобів забезпечення функціонування ЄАІС належать:
центри обробки даних та серверні приміщення;
центральне сховище даних, сервери додатків, технологічні сервіси (комплекси) та автоматизовані робочі місця користувачів ЄАІС;
відомча електронна комунікаційна мережа Держмитслужби (далі - ВКМ) і локальні обчислювальні мережі апарату Держмитслужби та її територіальних органів;
програмно-технічний комплекс Держмитслужби «Електронна пошта» (далі - ПТК «Електронна пошта»).