Протокол Вищої атестаційної комісії підписується головою та секретарем комісії. У протоколі зазначається інформація про заперечення або окремі думки членів Вищої атестаційної комісії з питань, які розглядаються. Пропозиції Вищої атестаційної комісії носять рекомендаційний характер для прийняття остаточного рішення Міністром оборони України.