Основні завдання Водолазної служби апарату ДСНС:
1) координація діяльності водолазних служб організаційних структур;
2) координація та організація заходів щодо проведення водолазних спусків для забезпечення аварійно-рятувальних та інших невідкладних робіт на водних об’єктах;
3) організація водолазної справи в органах та підрозділах ДСНС;
4) організація водолазних спусків і робіт на водних об’єктах;
5) розроблення та впровадження єдиних нормативно-правових і технічних вимог щодо розвитку водолазної справи в системі ДСНС;
6) участь у проведенні атестації аварійно-рятувальних служб і рятувальників;
7) забезпечення організації роботи Центральної водолазної кваліфікаційної комісії, координація діяльності водолазних кваліфікаційних комісій;
8) здійснення взаємодії з водолазними службами інших органів державної влади, підприємств, установ та організацій з питань удосконалення водолазної справи, у тому числі під час проведення заходів щодо запобігання і ліквідації надзвичайних ситуацій на водних об'єктах;
9) здійснення контролю за організацією охорони праці, дотриманням заходів безпеки під час водолазних спусків і робіт, медичним забезпеченням, соціальним захистом водолазного складу.