Основними структурними підрозділами центру є:
приймально-діагностичне відділення;
відділення медичної реабілітації;
відділення паліативної допомоги.
Для надання послуг з медичної реабілітації в центрі утворюються профільні відділення (неврологічне, сенсорне, опорно-рухове, фізіотерапевтичне та інші).
Для надання паліативної допомоги в центрі утворюються мобільні служби паліативної допомоги, служби респіраторної підтримки, консультативні служби, денний стаціонар (хоспіс) тощо.
Для надання послуг з тимчасового цілодобового догляду та виховання не більше ніж 10 дітям, які перебувають у складних життєвих обставинах, дітям, які залишилися без батьківського піклування, дітям-сиротам та дітям, позбавленим батьківського піклування, віком від народження до трьох років (для здорових дітей) та віком від народження до чотирьох років (для дітей з фізичними та/або інтелектуальними порушеннями) може утворюватися відділення тимчасового догляду та виховання дітей. Тимчасове влаштування дітей до такого відділення та організація їх соціального захисту здійснюються відповідно до Порядку організації соціального захисту дитини, тимчасово влаштованої на цілодобове перебування до закладу незалежно від типу, форми власності та підпорядкування та її підготовки до повернення у свою сім’ю, влаштування до сімейної форми виховання, в умови, наближені до сімейних, або усиновлення, затвердженого постановою Кабінету Міністрів України від 2 жовтня 2026 р. № 1212 “Деякі питання організації соціального захисту дитини, тимчасово влаштованої на цілодобове перебування до закладу незалежно від типу, форми власності та підпорядкування та її підготовки до повернення у свою сім’ю, влаштування до сімейної форми виховання, в умови, наближені до сімейних, або усиновлення”. Таке відділення утворюється у разі, коли під час воєнного стану на території області, м. Києва, де функціонує центр, тимчасово відсутня мережа сімей патронатних вихователів, що задовольняє потреби у тимчасовому влаштуванні дітей, та недоступні центри матері та дитини, відділення для батьків з дітьми та відділення термінового влаштування дітей центрів соціальної підтримки дітей та сімей.
{Пункт 9 доповнено абзацом згідно з Постановою Кабінету Міністрів України № 1212 від 02.10.2026 }