У центрі, будинку, клубі еколого-натуралістичної творчості учнівської молоді, на станції юних натуралістів діє методична рада, до складу якої входять педагогічні працівники закладу та інші учасники навчально-виховного процесу. Методична рада є дорадчим органом.
Методична рада:
координує науково-методичну, організаційну та практичну діяльність закладу з питань екологічної освіти та виховання, дослідницької роботи в галузі біології, сільського та лісового господарства;
заслуховує повідомлення з питань удосконалення навчально-виховної, організаційно-методичної, науково-дослідної роботи;
вивчає, узагальнює та поширює перспективний педагогічний досвід;
дає експертні оцінки щодо якості навчально-методичної літератури з позашкільної освіти;
обговорює проекти нових навчальних програм, аналізує пропозиції щодо удосконалення діючих;
поширює інновації у системі позашкільної освіти;
приймає рішення про доцільність участі у науково-практичній конференції, симпозіумі тощо.