Захист інформації в АС «ІРЦ» забезпечується шляхом функціонування комплексної системи захисту інформації (далі - КСЗІ) з атестованою відповідністю вимогам технічного захисту інформації. КСЗІ АС «ІРЦ» забезпечує захист від порушень цілісності даних, різні види доступності (блокування) відкритої інформації та інформації з обмеженим доступом, вимогу щодо захисту якої встановлено законодавством України.