Відділи очолюють начальники відділів. Начальники відділів представництва інтересів держави в суді, а також організації процесуального керівництва досудовим розслідуванням та підтримання публічного обвинувачення в обласних прокуратурах мають по одному заступнику, які виконують обов'язки начальників відділів у разі їх відсутності.
У разі відсутності начальників відділів процесуального керівництва досудовим розслідуванням та підтримання публічного обвинувачення, організації процесуального керівництва досудовим розслідуванням та підтримання публічного обвинувачення у кримінальних провадженнях у сфері охорони навколишнього природного середовища, пов'язаних зі збройною агресією, організаційно-методичної роботи та документального забезпечення їхні обов'язки виконує один із прокурорів цих відділів згідно з наказом Генерального прокурора.