Робочу групу очолює голова, який за посадою є першим заступником Голови Служби - керівником Антитерористичного центру при Службі безпеки України.
Голова робочої групи має заступника (заступників), який (які) виконує (виконують) окремі його доручення та виконує (виконують) обов'язки голови у разі його відсутності.
Забезпечення поточної роботи Робочої групи здійснює її секретар.