Експертиза проєкту дослідження та/або розробки здійснюється у Системі трьома експертами, з урахуванням таких вимог:
призначення проєктів у Системі певному експерту здійснюється виключно в автоматичному режимі з урахуванням його спеціалізації, яка має відповідати тематиці поданого проєкту з урахуванням уникнення потенційного конфлікту інтересів;
розподіл проєктів між експертами здійснюється автоматизовано в Системі із врахуванням виду Конкурсу (основний конкурс проєктів або конкурс проєктів молодих вчених), їхньої наукової спеціалізації, що має відповідати тематиці поданого проєкту, та з дотриманням принципу запобігання потенційному конфлікту інтересів;
експерт зобов’язаний самостійно відмовитися від оцінювання проєкту, якщо ним виявлено конфлікт інтересів, не зафіксований Системою, або існує ризик порушення ним положень Кодексу. У такому разі Система автоматично призначає іншого експерта.
Система автоматично направляє проєкт на розгляд Комісії, якщо за результатами експертизи виявлено крайні межові оцінки («0» або «100»). У разі прийняття Комісією рішення про скасування такої експертизи, в автоматизованому режимі призначається новий експерт.
Система автоматично направляє проєкт на розгляд Комісії, якщо один із експертних висновків відхиляється більш ніж на ±25% від середнього балу за проєктом. У разі скасування такого висновку за рішенням Комісії, в автоматизованому режимі призначається інший експерт.
Після завершення всіх основних і додаткових експертиз, розрахунок середнього експертного балу проєкта дослідження та/або розробки, здійснюється в Системі автоматично.
Середній експертний бал проєкта дослідження та/або розробки вираховується як середнє арифметичне значення оцінок, виставлених трьома експертами з урахуванням додаткових експертиз у разі їх наявності.
Рішення експертів з урахуванням додаткових експертиз є незалежним і остаточним. Механізмів апеляції результатів експертизи не передбачено.