Відповідно до Закону України "Про організаційно-правові основи боротьби з організованою злочинністю" ( 3341-12 ) Головне управління по боротьбі з корупцією і організованою злочинністю Центрального управління Служби безпеки України очолює начальник, який призначається на посаду і звільняється з неї Президентом України за поданням Голови Служби безпеки України, погодженим з Комісією Верховної Ради України з питань боротьби з організованою злочинністю і корупцією. Начальник Головного управління є заступником Голови Служби безпеки України за посадою.