Контрольна експертиза провадиться для перевірки висновків первинної експертизи або окремих її положень з ініціативи організатора експертизи. За ініціативою замовника здійснюється також проведення контрольної експертизи.
Для проведення контрольної експертизи залучаються експерти, які не брали участі в проведенні первинної експертизи. Висновки контрольної експертизи, якщо вони збігаються з висновками первинної експертизи, остаточні. Якщо між висновками первинної і контрольної експертиз існує розбіжність, то організатор продовжує експертну роботу до остаточного з'ясування питання та вироблення обгрунтованого висновку.