Організацію та ведення підреєстру, удосконалення його функціонування на всіх рівнях управління та використання накопиченої інформації забезпечують Український центр інформаційних технологій та Національного реєстру, Головне військово-медичне управління Міністерства оборони України, Науково-дослідний інститут проблем військової медицини Збройних Сил України.