Організація і безпосереднє керівництво науковими дослідженнями і екологічним моніторингом, що проводяться в ПЗУ, здійснюється, насамперед, заступником директора з наукової роботи. В окремих випадках організація і безпосереднє керівництво науковими дослідженнями і екологічним моніторингом у ПЗУ може здійснюватися начальником наукового відділу, старшим, провідним чи головним науковим співробітником, який призначений керівником теми.