Управління очолює начальник, який призначається на посаду і звільняється з посади в установленому порядку Головою Держкомлісгоспу України.
Начальники Управлінь мають заступників, які призначаються на посаду та звільняються з посади начальниками Управлінь за погодженням з Головою Держкомлісгоспу України.