Управління центром у межах повноважень, визначених законами України та установчими документами центру, та з урахуванням особливостей функціонування установи здійснюють:
засновники;
директор центру;
загальні збори (конференція) трудового колективу;
педагогічна рада;
інші органи, визначені установчими документами центру.