Науковий спостерігач на риболовному судні перебуває під юрисдикцією держави прапора та зобов’язаний здійснювати свою діяльність відповідно до вимог (документів) МОУР, що регламентують роботу наукового спостерігача, та законодавства держави прапора з питань, не врегульованих документами МОУР.