До функціональних модулів системи належать:
1) модуль веб-ресурсу системи;
2) модуль наповнення профілів системи;
3) модуль розширеного пошуку;
4) модуль адміністрування системи;
5) модуль кабінету користувача системи;
6) модуль проведення процедури реєстрації наукових установ, яким надається підтримка держави;
7) модуль проведення процедури реєстрації наукових об’єктів, що становлять національне надбання;
8) модуль процедури ведення Реєстру дослідницьких інфраструктур;
9) модуль проведення процедури державної акредитації фізичних та юридичних осіб на право проведення наукової і науково-технічної експертизи;
10) модуль проведення процедури державної реєстрації технологічних парків;
11) модуль проведення процедури формування реєстру наукових парків;
12) модуль електронних каталогів наукових бібліотек;
13) модуль проведення процедури атестації наукових працівників;
14) модуль проведення процедури державної атестації наукових установ та закладів вищої освіти в частині провадження ними наукової (науково-технічної) діяльності;
15) модуль проведення конкурсів наукових проектів у межах державних, галузевих та науково-технічних програм;
16) модуль проведення процедури реєстрації фахових видань;
17) модуль оновлення центральної бази даних системи;
18) модуль єдиної авторизації в українських наукових системах;
19) модуль програмного інтерфейсу для надання даних стороннім системам;
20) модуль комунікаційної платформи “Наука і бізнес”;
21) модуль проведення процедури реєстрації наукових та науково-практичних заходів;
22) модуль порядку проведення реєстрації наукових установ, яким надається статус національних наукових центрів;
23) інші системи, реєстри та сторонні інформаційні ресурси, створені суб’єктами системи в межах реалізації своїх повноважень (у разі їх інтеграції до системи).