Ліквідація Ради здійснюється Міністерством освіти за згодою Кабінету Міністрів України, а також у передбачених законодавством випадках:
- у зв'язку з неможливістю здійснення Радою діяльності, передбаченої цим Положенням;
- у випадках оголошення її неспроможності за рішенням суду;
- внаслідок неодноразового порушення з боку Ради чинного законодавства або цього Положення.