Організація і проведення Конкурсу забезпечуються Організаційним комітетом (далі - Оргкомітет), визначеним Міністерством освіти і науки України.
Для безпосереднього забезпечення проведення Конкурсу в регіонах Оргкомітетом створюється Координаційна рада Конкурсу, до якої входять представники Оргкомітету, Міністерства освіти і науки України та/або Інституту інноваційних технологій і змісту освіти Міністерства освіти і науки України, регіональні координатори Конкурсу (координатор в Автономній Республіці Крим, обласні координатори, міські координатори в містах Києві та Севастополі), представники громадських організацій (за згодою), інші особи, запрошені Оргкомітетом.
До повноважень Оргкомітету належать:
визначення структури завдань, часу, який надається для їх виконання, критеріїв оцінювання тощо;
визначення дати проведення Конкурсу;
організація перевірки робіт Учасників Конкурсу;
оприлюднення результатів Конкурсу і визначення його переможців;
опрацювання зауважень учасників щодо проведення Конкурсу та його завдань;
координація та виготовлення матеріалів Конкурсу (у вигляді видання інформаційних вісників, посібників, науково-популярних видань, статей, відеоматеріалів, компакт-дисків тощо), розміщення таких матеріалів у мережі Інтернет тощо;
підготовка та подання пропозицій до Міжнародного оргкомітету BEBRAS для формування банку завдань Конкурсу;
проведення семінарів та нарад Координаційної ради з метою підбиття підсумків та підготовки до наступного Конкурсу;
проведення для педагогічних працівників та учнів інших наукових, методичних та освітніх заходів, пов’язаних з Конкурсом.