У малій академії наук учнівської молоді може діяти методична рада, до складу якої входять педагогічні працівники закладу.
Методична рада є дорадчим органом.
Методична рада:
координує науково-методичну, організаційну та практичну діяльність закладу з питань здобуття вихованцями (учнями, слухачами) позашкільної освіти з різних напрямків науково-дослідницької діяльності;
заслуховує повідомлення та пропозиції з питань удосконалення навчально-виховної, організаційно-методичної, дослідницької, пошукової та експериментальної роботи з різних проблем науки, техніки, мистецтва;
вивчає, узагальнює та поширює кращий педагогічний досвід;
обговорює проекти нових навчальних програм, аналізує пропозиції щодо вдосконалення діючих;
поширює інновації у системі позашкільної освіти тощо.