З метою розвитку та вдосконалення навчально-виховного процесу, професійної діяльності педагогічних працівників у малій академії наук учнівської молоді створюється педагогічна рада - постійно діючий колегіальний орган управління закладу.
Головою педагогічної ради є директор.
Педагогічна рада малої академії наук учнівської молоді:
розглядає плани, підсумки й актуальні питання навчально-виховної, організаційно-масової та інформаційно-методичної роботи закладу, його структурних підрозділів, гуртків, груп та інших творчих об'єднань, а також питання дотримання санітарно-гігієнічних вимог, забезпечення техніки безпеки, охорони праці;
розробляє пропозиції щодо поліпшення діяльності закладу;
визначає заходи щодо підвищення кваліфікації педагогічних кадрів, упровадження у навчально-виховний процес досягнень науки і кращого педагогічного досвіду;
розробляє рекомендації з питань організації навчально-виховного процесу, налагодження міжнародних освітніх та наукових зв'язків;
захищає права педагогічних працівників на педагогічну ініціативу, вільний вибір форм, методів і засобів навчання, аналізує форми, методи і засоби навчання та скасовує такі, що не придатні для використання в навчальному процесі;
розглядає інші питання професійної діяльності педагогічних працівників та навчально-виховного процесу закладу;
порушує клопотання про призначення вихованцям (учням, слухачам) персональних та іменних стипендій, грантів за умови наявності відповідних коштів;
порушує клопотання про заохочення педагогічних працівників.
Кількість засідань педагогічної ради визначається їх доцільністю, але не може бути менше ніж два рази на рік.