Заступник командира з'єднання кораблів з виховної роботи в мирний і воєнний час відповідає за: безпосередню організацію й проведення виховної роботи; військову дисципліну, морально-психологічний стан особового складу; морально-психологічне забезпечення бойової готовності, бойової підготовки, виконання бойових завдань, правопорядку, повсякденної діяльності особового складу з'єднання кораблів; гуманітарну підготовку та інформаційну роботу, організацію дозвілля військовослужбовців, членів їх сімей та працівників з'єднання, їх соціальний захист.
Заступник командира з'єднання кораблів з виховної роботи підпорядковується командирові з'єднання кораблів і є прямим начальником усього особового складу з'єднання кораблів.